Epidemiología molecular de cepas de Mycobacterium tuberculosis
Epidemiología molecular de cepas de Mycobacterium tuberculosis
Por: Yared Merid, Elena Hailu, Getnet Habtamu, Melaku Tilahun, Markos Abebe, Mesay Hailu, Tsegaye Hailu, Daniel G Datiko, Yimtubezinash Woldeamanuel y Abraham Aseffa
Publicación: Revista de infección en países en desarrollo 30 de septiembre de 2021 DIO: 10.3855/jidc.14742
Resumen
Introducción
La comprensión de la epidemiología de la tuberculosis está limitada por la falta de datos de genotipado. Intentamos caracterizar los patrones de prueba de susceptibilidad a los medicamentos y la diversidad genética de los aislamientos de M. tuberculosis en el sur de Etiopía.
Metodología
Se realizó un estudio transversal entre pacientes recién diagnosticados con baciloscopía positiva con tuberculosis que visitaron nueve centros de salud en el sur de Etiopía desde junio de 2015 hasta mayo de 2016. Se examinaron tres muestras de esputo consecutivas (spot-morning-spot) por paciente utilizando bacilos acidorresistentes microscopía de frotis con todos los especímenes con frotis positivos que tienen cultivos de bacilos acidorresistentes realizados. Los aislamientos de M. tuberculosis se sometieron a pruebas de susceptibilidad a fármacos mediante el método de proporción indirecta y se genotipificaron con análisis de eliminación de RD9 y spoligotyping. El mapeo de la deformación se realizó utilizando un sistema de información geográfica.
Resultados
Entre 250 pacientes recién diagnosticados con tuberculosis, el 4% estaban coinfectados con el VIH. Los 230 aislamientos analizados eran cepas de M. tuberculosis pertenecientes a tres linajes: euroamericano, 187 (81 %), este africano-indio, 31 (14 %) y linaje 7 (linaje etíope), 8 (4 %); categorizados en 63 patrones de espoligotipos diferentes, de los cuales el 85% caía en 28 grupos. Las cepas de M. tuberculosis se agruparon por localidades geográficas. Los espoligotipos dominantes fueron SIT149 (21%) y SIT53 (19%). Las pruebas de susceptibilidad a los medicamentos encontraron que el 14 % de los aislamientos analizados eran resistentes a > 1 medicamento antituberculoso de primera línea y el 11 % a la INH. SIT 149 fue dominante entre los aislados resistentes a fármacos.
Conclusiones
El estudio reveló varios grupos y cepas de M. tuberculosis resistentes a los medicamentos en el área de estudio, lo que sugiere una transmisión reciente, incluida la tuberculosis resistente a los medicamentos. Se requiere un seguimiento más amplio de las pruebas de susceptibilidad a los medicamentos y un análisis geoespacial de las tendencias de transmisión para controlar la tuberculosis en el sur de Etiopía.